Το Μουσείο Σύγχρονης Τέχνης βρίσκεται στην παλιά πόλη του Ρεθύμνου, κοντά στο ενετικό φρούριο «Φορτέτζα» και το Αρχαιολογικό Μουσείο Ρεθύμνου.